Test geneticu simplificatu per tutti i tipi di EB

I ricercatori anu viaghjatu in diversi paesi di l'Asia Sud-Est per travaglià cù i medichi lucali nantu à u diagnosticu è a gestione di i pazienti EB. Usanu a tecnulugia di sequenza più nova è di lettura longa per scopre i cambiamenti genetichi chì sò mancati da a tecnulugia di sequenza più antica di lettura corta.

Ricercatore principale: U Dr Tan hè furmatu cum'è genetista moleculare, cun un Master of Science da l'Università di Wisconsin - Madison è PhD da l'Istitutu di Biologia Molecular è Cellulare.

Co-investigatore: Dr Koh hè un dermatologu pediatricu cù un interessu speciale in i disordini genetichi di a pelle, cumpresu l'EB. Hà aiutatu à stabilisce DEBRA Singapore è cullabureghja spessu cù altri dermatologi pediatrici da a regione per gestisce i pazienti cù EB.

"Ancu se certi casi ponu esse diagnosticati clinicamente, e presentazioni sovrapposte è legate à l'età facenu sfida à fà un diagnosticu precisu di u tipu specificu. Ottene un diagnosticu geneticu in EB permetterà u diagnosticu precisu di u sottutipu specificu, chì hè impurtante per a prognosi à longu andà è a gestione adatta di i sintomi ... L'identificazione di a mutazione genetica hè ancu impurtante per e teste prenatali in casi severi è e teste familiale di biologicu. parenti, è guida e decisioni nantu à a pianificazione familiare ".

- Dr Tan

Titulu di cuncessione: Migliurà u diagnosticu geneticu di l'epidermolisi bullosa per sequenza di lettura longa.

L'epidermolisi bullosa (EB) hè una cundizione rara carattarizata da fragilità di a pelle, chì porta à vesciche è erosioni nantu à traumatismi minori. In certi tipi di EB, cicatrici pò esse secundariu à i vesciche è l'erosioni. In più di a pelle, l'EB pò ancu affettà a superficia mucosa rivestita da l'epiteliu, cum'è a bocca, l'esofago, u trattu gastrointestinali, u trattu urinariu è l'ochji. Cicatrici in questi tissuti ponu accade, purtendu à più cumplicazioni cum'è strette. L'EB pò ancu purtà à altre cumplicazioni cum'è l'anemia, a crescita povira è i prublemi ortopedici, è ancu un risicu aumentatu per certi tipi di cancers di a pelle, cum'è u carcinoma squamous cell. Tutti i quattru tippi principali di EB (EB simplex, EB junctional, EB distrophic, è sindromu Kindler) sò causati da anormalità genetica.

Siccomu l'EB hè clinicamente eterogeneu cù un spettru di gravità è presentazioni sovrapposte, pò esse difficiuli di distingue trà i tipi principali, è ancu i più di 30 sottotipi clinichi, soprattuttu durante i primi anni di vita. A cunferma moleculare deve esse fatta per un diagnosticu definitivu per aiutà à predichendu u risultatu à longu andà è guidà u trattamentu adattatu. A rata di successu in l'ottenimentu di un risultatu pusitivu per mezu di e teste genetiche varieghja da 50-90% per i metudi attuali di Sanger unicu o di sequenza di lettura corta multigene. A sequenza di lettura longa ùn hè micca stata aduprata largamente per investigà parechji geni EB. A tecnulugia di lettura longa Nanopore pò sequenzià frammenti longu di DNA per permette una sequenza più completa di u genu sanu pò esse risultatu in un rendimentu megliu in scopre mutazioni genetiche sottostanti, furnisce un diagnosticu più precisu.

E caratteristiche cliniche di i varii tipi di EB ponu sovrappone è spessu ponenu un dilema diagnosticu in a prima vita. I testi genetichi precoci è precisi ponu purtà à un diagnosticu puntuale di u sottutipu EB, chì furnisce una migliore prognosticazione è una gestione mejorata, è ancu per anticipà è monitorà e cumplicazioni.

Attualmente, a prova genetica hè da a sequenza simultanea di parechji geni o di l'esoma (regioni chì cuntenenu geni di u genoma), chì tipicamente sequenza frammenti brevi. A sequenza di nanopori di frammenti più longu (cumprese e regioni non codificanti) pò esse potenzialmente risultatu in un rendimentu diagnosticu più altu è scopre più varianti genetiche. Ottene un risultatu geneticu pusitivu hè impurtante per i pazienti. In i casi pediatrici severi, hè impurtante avè chjusu per i genitori è aiutu in u futuru gravidenza. L'identificazione di a variante genetica in una probanda permette ancu a valutazione di risicu per a famiglia estesa. L'infurmazione nantu à u difettu geneticu pò ancu esse aduprata per a prova di traspurtadore per e forme recessive di EB induve i dui alleli difetti sò ereditati da i dui genitori chì portanu ognunu una copia difettu. A prova genetica pò ancu esse realizata per identificà mutazioni spontanee per e forme dominanti di EB per teste prenatali o pre-implantation.

Per capisce megliu u cursu clinicu di a malatia sottu à i sintomi EB, avaristi bisognu di più varianti genetichi per esse identificati in parechji pazienti per correlate megliu i dati genetichi cù e presentazioni di a malatia. Scuprite più varianti genetichi porta ancu à una megliu comprensione di i prucessi molecolari durante a patogenesi di a malatia, chì pò purtà à u sviluppu di novi agenti farmacològichi è altri trattamenti.

Sò un genetista cun interessu à scopre a basa di e malatie cù una causa genetica. U mo co-investigatore hè un dermatologu cun interessu particulare in EB. Hè statu attivu in a cumunità EB lucale è ancu in a regione, viaghjendu in altri paesi di l'Asia Sud-Est per travaglià cù i medichi lucali nantu à u diagnosticu è a gestione di i pazienti EB. Avemu usatu a sequenza genetica per identificà l'anormalità moleculari di i disordini genetichi. A sequenza di a prossima generazione chì utilizeghja a tecnulugia di lettura corta (cum'è e plataforme Illumina è Ion) hè avà ben stabilita è hè diventata standard di cura in a pratica clinica, ma hà limitazioni in a gamma di anomalie genetiche chì ponu identificà. Travagliemu nantu à a nova tecnulugia di sequenza di lettura longa per spiegà scopre anormalità genetiche chì sò mancate da a sequenza di lettura corta, chì includenu eliminazioni, inserimenti è duplicazioni più grande.